MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 1345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022046	TAA	3	9	18	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022046	CAA	2	6	111	116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022046	ATG	2	6	133	138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022046	T	6	6	320	325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022046	T	6	6	368	373	0 %	100 %	0 %	0 %	530314051
6	NC_022046	CAA	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314051
7	NC_022046	CTACTT	2	12	608	619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530314051
8	NC_022046	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314051
9	NC_022046	TCC	2	6	651	656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_022046	TGA	3	9	692	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314052
11	NC_022046	AT	3	6	732	737	50 %	50 %	0 %	0 %	530314052
12	NC_022046	ATCA	2	8	759	766	50 %	25 %	0 %	25 %	530314052
13	NC_022046	CAAGA	2	10	833	842	60 %	0 %	20 %	20 %	530314052
14	NC_022046	T	7	7	885	891	0 %	100 %	0 %	0 %	530314052
15	NC_022046	CTG	2	6	902	907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314052
16	NC_022046	TCC	2	6	915	920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314052
17	NC_022046	TAG	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314052
18	NC_022046	ACC	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314052
19	NC_022046	AAT	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314052
20	NC_022046	ATT	2	6	1076	1081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314053
21	NC_022046	CAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314053
22	NC_022046	CAA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314053
23	NC_022046	CTT	2	6	1162	1167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314053
24	NC_022046	CAG	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314053
25	NC_022046	TAC	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314053
26	NC_022046	A	6	6	1245	1250	100 %	0 %	0 %	0 %	530314053
27	NC_022046	T	6	6	1326	1331	0 %	100 %	0 %	0 %	530314053
28	NC_022046	AAT	2	6	1332	1337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314053
29	NC_022046	T	6	6	1340	1345	0 %	100 %	0 %	0 %	530314053
30	NC_022046	CTG	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314053
31	NC_022046	ATA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314053
32	NC_022046	GAT	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022046	A	7	7	1668	1674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022046	T	6	6	1677	1682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022046	ATC	2	6	1735	1740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022046	CTA	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022046	TAG	2	6	1766	1771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022046	ATTT	3	12	1780	1791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022046	AAC	2	6	1811	1816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022046	TTCT	2	8	1842	1849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022046	GATA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022046	GTT	2	6	1893	1898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022046	T	7	7	1915	1921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022046	TGT	2	6	1928	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022046	GACT	2	8	1947	1954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022046	A	6	6	2018	2023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022046	AGA	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022046	A	6	6	2101	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022046	CT	3	6	2165	2170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022046	GAGG	2	8	2208	2215	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022046	CTAC	2	8	2263	2270	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022046	A	7	7	2299	2305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022046	A	6	6	2314	2319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022046	AAG	2	6	2330	2335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314054
55	NC_022046	TTA	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314054
56	NC_022046	A	7	7	2389	2395	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
57	NC_022046	TA	3	6	2516	2521	50 %	50 %	0 %	0 %	530314054
58	NC_022046	TGAT	2	8	2626	2633	25 %	50 %	25 %	0 %	530314054
59	NC_022046	AT	3	6	2665	2670	50 %	50 %	0 %	0 %	530314054
60	NC_022046	A	6	6	2679	2684	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
61	NC_022046	T	7	7	2766	2772	0 %	100 %	0 %	0 %	530314054
62	NC_022046	TGC	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314054
63	NC_022046	TGC	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314054
64	NC_022046	GCA	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314054
65	NC_022046	TAA	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314054
66	NC_022046	GAAA	2	8	3012	3019	75 %	0 %	25 %	0 %	530314054
67	NC_022046	CTA	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314054
68	NC_022046	CTA	2	6	3266	3271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314054
69	NC_022046	A	6	6	3276	3281	100 %	0 %	0 %	0 %	530314054
70	NC_022046	GTTT	2	8	3301	3308	0 %	75 %	25 %	0 %	530314054
71	NC_022046	AGA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314054
72	NC_022046	ATT	2	6	3426	3431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314054
73	NC_022046	T	6	6	3430	3435	0 %	100 %	0 %	0 %	530314054
74	NC_022046	AGA	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314054
75	NC_022046	AATA	2	8	3483	3490	75 %	25 %	0 %	0 %	530314054
76	NC_022046	AAT	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314054
77	NC_022046	ATC	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314054
78	NC_022046	CAA	2	6	3575	3580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022046	AT	3	6	3599	3604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022046	T	7	7	3640	3646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022046	TCAAT	2	10	3699	3708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022046	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022046	ATT	2	6	3788	3793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314055
84	NC_022046	AG	3	6	3820	3825	50 %	0 %	50 %	0 %	530314055
85	NC_022046	ATT	2	6	3956	3961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314055
86	NC_022046	AAAG	2	8	4097	4104	75 %	0 %	25 %	0 %	530314055
87	NC_022046	GCC	2	6	4110	4115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530314055
88	NC_022046	AAT	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314055
89	NC_022046	AT	3	6	4209	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	530314055
90	NC_022046	TTTCT	2	10	4251	4260	0 %	80 %	0 %	20 %	530314055
91	NC_022046	AATA	2	8	4270	4277	75 %	25 %	0 %	0 %	530314055
92	NC_022046	TG	3	6	4313	4318	0 %	50 %	50 %	0 %	530314055
93	NC_022046	AGT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314055
94	NC_022046	ATG	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314055
95	NC_022046	TTC	2	6	4468	4473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022046	AAT	2	6	4486	4491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022046	TAAA	2	8	4496	4503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022046	GTGA	2	8	4555	4562	25 %	25 %	50 %	0 %	530314056
99	NC_022046	A	8	8	4575	4582	100 %	0 %	0 %	0 %	530314056
100	NC_022046	CAAA	2	8	4611	4618	75 %	0 %	0 %	25 %	530314056
101	NC_022046	A	6	6	4637	4642	100 %	0 %	0 %	0 %	530314056
102	NC_022046	CAA	2	6	4678	4683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314056
103	NC_022046	CATG	2	8	4699	4706	25 %	25 %	25 %	25 %	530314056
104	NC_022046	CAA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314056
105	NC_022046	TTA	2	6	4915	4920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314056
106	NC_022046	GA	3	6	4976	4981	50 %	0 %	50 %	0 %	530314056
107	NC_022046	ATA	2	6	5007	5012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314056
108	NC_022046	T	6	6	5013	5018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022046	GAT	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022046	A	6	6	5047	5052	100 %	0 %	0 %	0 %	530314057
111	NC_022046	GTTT	2	8	5061	5068	0 %	75 %	25 %	0 %	530314057
112	NC_022046	A	8	8	5069	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	530314057
113	NC_022046	TAAA	2	8	5079	5086	75 %	25 %	0 %	0 %	530314057
114	NC_022046	GAT	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314057
115	NC_022046	TAG	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314057
116	NC_022046	ATC	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314057
117	NC_022046	TACTT	2	10	5185	5194	20 %	60 %	0 %	20 %	530314057
118	NC_022046	AT	3	6	5212	5217	50 %	50 %	0 %	0 %	530314057
119	NC_022046	TCC	2	6	5223	5228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314057
120	NC_022046	AT	3	6	5233	5238	50 %	50 %	0 %	0 %	530314057
121	NC_022046	CCA	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314057
122	NC_022046	GCA	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314057
123	NC_022046	TGA	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314057
124	NC_022046	CTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314057
125	NC_022046	TTG	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314057
126	NC_022046	GTA	2	6	5354	5359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314057
127	NC_022046	TGG	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314057
128	NC_022046	CT	3	6	5400	5405	0 %	50 %	0 %	50 %	530314057
129	NC_022046	ATA	2	6	5419	5424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314057
130	NC_022046	TTATT	2	10	5460	5469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022046	TAT	2	6	5484	5489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022046	TAA	2	6	5525	5530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022046	A	7	7	5589	5595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022046	AAG	2	6	5613	5618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022046	CTT	2	6	5637	5642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022046	TGT	2	6	5648	5653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022046	TCA	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
138	NC_022046	TAG	3	9	5757	5765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314058
139	NC_022046	AATG	2	8	5841	5848	50 %	25 %	25 %	0 %	530314058
140	NC_022046	TCG	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314058
141	NC_022046	CAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314058
142	NC_022046	CAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
143	NC_022046	CCA	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314058
144	NC_022046	TAT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314058
145	NC_022046	TAT	2	6	6104	6109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314058
146	NC_022046	ATA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
147	NC_022046	GT	3	6	6127	6132	0 %	50 %	50 %	0 %	530314058
148	NC_022046	GCA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314058
149	NC_022046	TTC	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
150	NC_022046	GATA	2	8	6496	6503	50 %	25 %	25 %	0 %	530314058
151	NC_022046	TTC	2	6	6609	6614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
152	NC_022046	T	6	6	6646	6651	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
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157	NC_022046	T	7	7	6927	6933	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
158	NC_022046	CTT	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
159	NC_022046	TCA	2	6	6985	6990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
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162	NC_022046	CCAT	2	8	7069	7076	25 %	25 %	0 %	50 %	530314058
163	NC_022046	T	6	6	7082	7087	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
164	NC_022046	ATA	2	6	7105	7110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
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172	NC_022046	ATT	3	9	7399	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314058
173	NC_022046	AT	3	6	7412	7417	50 %	50 %	0 %	0 %	530314058
174	NC_022046	TAA	2	6	7431	7436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
175	NC_022046	CAA	2	6	7472	7477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314058
176	NC_022046	AG	3	6	7489	7494	50 %	0 %	50 %	0 %	530314058
177	NC_022046	TAA	2	6	7517	7522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314058
178	NC_022046	TCA	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314058
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181	NC_022046	TTC	2	6	7605	7610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314058
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184	NC_022046	T	6	6	7748	7753	0 %	100 %	0 %	0 %	530314058
185	NC_022046	CTT	2	6	7783	7788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314059
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193	NC_022046	TAT	2	6	8166	8171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_022046	CATC	2	8	8179	8186	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_022046	TAA	2	6	8273	8278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_022046	ATA	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_022046	TAA	2	6	8326	8331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_022046	TTA	2	6	8399	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314060
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216	NC_022046	GTTT	2	8	9060	9067	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
217	NC_022046	AT	3	6	9122	9127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
218	NC_022046	AAT	2	6	9130	9135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_022046	A	7	7	9216	9222	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
223	NC_022046	A	7	7	9246	9252	100 %	0 %	0 %	0 %	530314061
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249	NC_022046	AG	3	6	10468	10473	50 %	0 %	50 %	0 %	530314061
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258	NC_022046	GA	3	6	10918	10923	50 %	0 %	50 %	0 %	530314062
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263	NC_022046	TTAA	2	8	11247	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	530314039
264	NC_022046	GAAT	2	8	11287	11294	50 %	25 %	25 %	0 %	530314039
265	NC_022046	CTT	2	6	11308	11313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314039
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269	NC_022046	CTC	2	6	11449	11454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314039
270	NC_022046	TTTG	2	8	11527	11534	0 %	75 %	25 %	0 %	530314039
271	NC_022046	GTT	2	6	11636	11641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314039
272	NC_022046	TCC	2	6	11652	11657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314039
273	NC_022046	CTT	2	6	11695	11700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314039
274	NC_022046	ATA	2	6	11714	11719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314039
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276	NC_022046	T	7	7	11854	11860	0 %	100 %	0 %	0 %	530314039
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409	NC_022046	A	6	6	17098	17103	100 %	0 %	0 %	0 %	530314066
410	NC_022046	TTGGA	2	10	17105	17114	20 %	40 %	40 %	0 %	530314066
411	NC_022046	TCA	3	9	17163	17171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314066
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417	NC_022046	AATC	2	8	17367	17374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
418	NC_022046	T	9	9	17394	17402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_022046	AAT	2	6	17406	17411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_022046	A	6	6	17424	17429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_022046	A	6	6	17443	17448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_022046	GAA	2	6	17452	17457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_022046	GAAC	2	8	17467	17474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
424	NC_022046	TC	3	6	17502	17507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
425	NC_022046	T	6	6	17508	17513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_022046	TTTG	2	8	17540	17547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
427	NC_022046	TTG	2	6	17580	17585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_022046	GGTA	2	8	17816	17823	25 %	25 %	50 %	0 %	530314067
436	NC_022046	GA	3	6	17872	17877	50 %	0 %	50 %	0 %	530314067
437	NC_022046	T	6	6	17999	18004	0 %	100 %	0 %	0 %	530314043
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445	NC_022046	TCTAT	2	10	18276	18285	20 %	60 %	0 %	20 %	530314043
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498	NC_022046	TAA	2	6	20538	20543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_022046	ATA	2	6	20583	20588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_022046	A	6	6	20615	20620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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